Pocos saben que el lugar que ocupa El Ángel del Jardín fue durante algo más de tres siglos la ubicación del cementerio de la Iglesia de San Sebastián y que su historia está vinculada a la vecina parroquia. El camposanto existió hasta bien entrado el siglo XIX, a pesar de que en Madrid quedaron expresamente prohibidos los enterramientos en las iglesias. Allá por el año 1554 se encargó la construcción de la Iglesia a Don Antonio Sillero, maestro de obras de la Villa de Madrid, para que la parroquia creada diez años antes sobre una antigua ermita, que estaba situada en el camino de Atocha, tuviera un templo propio. Desde que concluyen las obras en 1575 hasta nuestros días aquí ha estado, unas veces reformada, otras destruida y vuelta a construir.

Estuvo muy ligada a los comediantes y a los arquitectos, pues en ella se domiciliaron estas dos cofradías de mucho raigambre y tradición madrileña: y la de Nuestra Señora de la Novena, que agrupa a los cómicos y demás gente del teatro, y la de Nuestra Señora de Belén, a la que pertenecen los arquitectos y ésta es la razón de que el actual Ángel del Jardín fuera conocido durante el conocido durante mucho tiempo como “Cementerio de los cómicos”.

En el cementerio estuvieron los restos de Lope de Vega cuando su patrón, el Duque de Sessa dejó de pagar la capilla donde había sido enterrado el dramaturgo, dentro de la propia iglesia. También los restos de dos de los arquitectos que cambiaron Madrid en el sigo de las Luces, Ventura Rodriguez y Juan de Villanueva.